服务简介
全转录组是指特定物种、组织或细胞类型在某个时期或条件处理下，能转录出来的所有 RNA（转录本）的总和，包括 mRNA 和非编码 RNA (ncRNA)。目前所说的全转录组测序，主要针对mRNA 和三种 ncRNA，即 lncRNA、circRNA 和 miRNA 进行测序分析。全转录组测序实验的优势在于，既可利用高通量测序技术全面快速得到已知基因（广义上指mRNA、 lncRNA、 circRNA、 miRNA）的表达丰度变化；同时可以通过测定的序列信息精确地分析 mRNA 的 cSNP/InDel（即编码序列的单核苷酸多态性/插入缺失）、可变剪接、基因融合等，以及不同类型 RNA 的序列及结构变异研究；而且通过增加测序数据量，有助于检测低丰度转录本和发现新转录本；进而整合分析同一样本中的多种类型 RNA，明确这些 RNA 之间的共表达和相互作用/调控关系。 全转录组测序项目需要同时构建两个测序文库，包括 rRNA 去除的链特异性文库和小 RNA 文库。
应用领域
生长发育机制研究
逆境胁迫机制研究
转录调控研究
功能基因发掘
技术路线
研磨称量
RNA抽提
文库构建
上机测序
数据解析
报告出具
技术优势
高通量，多种类型 RNA同时检测
Illumina Novaseq 6000测序平台覆盖更广泛
专业的技术服务团队
样本要求
1、样品类型
植物组织，细胞，微生物（细菌/真菌）和液体类；
2、生物学重复
建议3次及以上生物学重复；
3、样品需求量
植物组织≥200mg、细胞≥107、微生物（细菌/真菌）≥200mg、液体类≥2.5ml，特殊情况请与公司联系；
4、样品准备
样本准备基本原则有：代表性原则、迅速性原则、分装备份原则、污染控制原则、低温原则，公司可提供详细的样本准备和运输指南；
5、保存和运输
样本用液氮速冻，-80度保存或者直接干冰寄送即可；
6、样品标记要求
样品标记清晰，尽量使用英文和数字组合，字符数在15个以内为好，同时按照公司的技术需求表填写样本详细信息；
7、其他
客户认真填写公司的技术需求表，表格信息不全会对后期项目进行产生诸多影响，请填写后务必随样品一起邮寄。
结果示例
部分分析结果
参考文献
1) Whole-transcriptome sequencing reveals a vernalization-related ceRNA regulatory network in chinese cabbage (Brassica campestris L. ssp. Pekinensis.
2) Molecular memory of Flavescence dorée phytoplasma in recovering grapevines.
3) Whole-genome, transcriptome, and methylome analyses provide insights into the evolution of platycoside biosynthesis in Platycodon grandiflorus, a medicinal plant.